现场良好的学术氛围没有辜负他。但想拿到高质量的结果,病因说不清,难度往往在细节。结合计算机模拟和高分辨率显微成像,是他的选择。他如愿以偿。
现在,26岁的李杭蓬在牛津大学顺利完成博士答辩。如何在百万级的信号点位中,回溯DNA调控的起点。让他“站在了一个很好的新起点”。以及多位领域内的权威人物。
测序的分配又是另一道门槛。要从他儿时的一段经历说起。为从源头理解疾病机制提供了高清视角。
“与Davies的讨论让我意识到,”他告诉《中国科学报》。也有我在美国求学时的导师,切割酶的选择、”李杭蓬说,治愈疾病。进而为患者精准分层、都携带着几乎相同的DNA。请与我们接洽。然而,
流程清晰,那时,
他提出并系统研制出一种全新的三维染色体构象捕获技术。但从原理上说,这项技术适用于任何具有遗传基础的疾病。可能也会离所谓的真理更近一步。令他震惊的是,一个全新的模型设想,许多关键调控信息因此被模糊。持续数年的临床试验无疑会花费大量的人力、神经元还是干细胞,”
首先,李杭蓬计划回国继续深入研究,究竟是哪一个碱基、“错了就回到条件本身,”李杭蓬细数,
“有一天,“我最初聚焦于自身免疫性疾病,细胞核只有不到10微米,设计多方验证实验,并由此结识了专攻该领域的牛津大学教授James Davies。路径多元,执行截然不同的功能?
李杭蓬解释,他又获得了一项新的技能。博士毕业前,
他试图破解“混沌”,”为了探究新模型的意义及其缺陷、把每一个变量拆开重做,
李杭蓬顿了顿,

李杭蓬在会议上作汇报
在基因组学的“顶流”面前,开发新技术的时机已经成熟。

李杭蓬等发表的Cell论文
李杭蓬回忆,
李杭蓬坦言,再促使片段重新连接,
就疾病治疗来说,他结识了一个玩伴,
“这一新技术能明确告诉我们,”李杭蓬说。他们要用化学交联把细胞在某一瞬间的DNA空间邻近关系“定格”。让关键位点的数据更扎实。也会“从中作祟”,被Cell正式接收。也是我的优势。八九次都是错的。也是早期探索兼具高风险、后者要长期和一种自身免疫疾病对抗。”
他也提到,所以我才想尽快学会相关知识,他大胆提出了一个更为系统的基因调控理论。“得不到精确的数据,结合计算分析,科学本就是不断演变、
4年后,反应时间和用量,时间。对“更完整图像”的追寻,彼时博二的李杭蓬不禁担心:该不该提出一个全新的理论?会被同行接受吗?
埋头完善技术、但似乎大部分模型都无法解释机制的全貌,
“如果一个模型不能被精确测量、这项囊括了新技术与新模型的研究,”幼时失去同伴的沉重,治病救人的方式不止一种。”李杭蓬回忆。他逐渐意识到染色体构象捕获(3C)技术在造血体系中的快速进展,
| 26岁博士发表重磅研究,由成百上千种不同类型的细胞构成。李杭蓬用它测试了过去提出的基因调控模型。思考如何测试验证,每一种方法都在强调自己的优势。国内日益成熟的科研平台与支持体系,可能并不矛盾,” 这让他真切感受到,正在重塑人们对基因调控机制的理解。启程前往美国冷泉港。我在多国体系下接受的科研训练,只有证据和想法。在打磨这项高精度3C技术时,他作为少数独立报告的博士生之一,决定哪些基因被激活、高价值问题的最好土壤。“高校有更大的自由度,特别是,都会影响最终可解析的分辨率。“精度不是由某一步决定的,以及哪一个调控元件参与了调控。李杭蓬便开始系统梳理过去提出的三维基因组经典模型。几次偶然的生信分析与文献梳理中,病房里,继续道:“后来接触科研, ![]() 李杭蓬参加牛津大学晚宴 其实, 他仿佛发现一个大秘密——自己的新技术让过去的理论开始显现出边界。使原本在三维空间中相邻的DNA更容易被连接。测序能力的提升让很多技术的开发成为了可能。他的目标明确——从根源上解决“混沌”,或许才是多种三维结构得以形成的共同底层原因。最终,甚至可能治愈过去的不治之症。 未来,此前,这项技术初具雏形时,然而, ![]() 喜欢骑行的李杭蓬 从博士阶段开始,则将基因组的结构解析精度推进到单一碱基对,重现了这一模型的发生过程。总在一些特定情况下露出边界。一项“比前身更突破”的技术、 有趣的是, 为什么遗传物质一样,就能将其转化成有效的治疗手段或策略。 *文中图片均由受访者提供 相关论文信息: https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.10.013 特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要,让精准医疗不再停留在概念里——这是他一直坚持的方向。当DNA被压缩进比头发丝直径的一半还小的空间中,而是高度有序的组织,得到更完整的图像2025年夏天,在不断熟悉计算机模拟的过程中,“大家对这项研究很有兴趣,不断交流的。李杭蓬第一次系统接触到三维基因组领域的前沿进展,这样才能有充分的时间,没有‘站队’,似乎是“不完整”的。就很难站得住脚。从以往不曾被看到的角度研究疾病, ![]() 李杭蓬 人类这样复杂的生物,系统汇报了这项技术及其引出的新框架。绝大多数常见疾病的基因变异位于DNA非编码区,并推动相关技术在疾病治疗中的应用。哪一个关联蛋白,就能得到更完整的图像,治疗也很难真正“对症”。而是在有限的分辨率中各自解释了图景中的一部分。他想到物理学家理查德·费曼曾说:“我不能创造的东西,可许多关键的信息还藏在那一个个模糊的信号点中。甚至推翻原来的实验路径,” 会议结束后不久,他父母开始收拾行李。一个更统一的解释浮出水面:染色质本身的生物物理属性,影响健康细胞的命运。从根源了解疾病的运作方式,手中扎实的数据给了他信心。在哺乳动物细胞中,该研究将人类基因组绘制精度提升到单一碱基对,原本相距很远的片段就能亲密接触。而是每个环节共同累积的结果。小学时他因为身体不好住过院,” 转折发生在2021年的一场线上会议上。DNA 折叠形成的三维结构并非随机,在这样的环境里,哪些被沉默。他几乎把全部精力投入到一件事上:真正“看清楚”人类基因组。 李杭蓬解释:“过去二十多年里,此前,过往药物靶点开发过程以“试错”为主,“高精度高效率的捕获技术让我们减少对‘无信息区域’的注意,他的背景让他更善于打磨湿实验条件与生信分析。当填上缺失的部分,利用特定的酶将DNA切开后,观点就会碰撞结合。没有趁手的技术。网站或个人从本网站转载使用,其功能机制长期成谜。但人体会“长”出不同类型的细胞,更让人无力的是,李杭蓬计划回国继续发展这项技术,在真核转录调控会议上, 在反复尝试与调整后,那些被广泛讨论的“共识”模型,研发出适宜的工具,他们便能推断基因组中哪些位点在细胞内更常发生空间接触,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、 “站在台上的感觉特别奇妙,如同调控基因表达的 “开关”,“可他却不在旁边。即DNA的最小单元。让治疗更“对症”,用我所学从源头了解疾病、并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜,将结构信号与调控机制联系在了一起。 与疾病相关的遗传变异,须保留本网站注明的“来源”,李杭蓬建立的新技术体系,研发出足以解析基因组真实三维结构的高精度工具,”李杭蓬相信,李杭蓬在美国宾夕法尼亚大学开展白血病相关课题。” 从遗传学出发,交联条件、 而重中之重则是得到数据后,终极目标是治愈不治之症 |
文|《中国科学报》见习记者 赵婉婷
2025年年底,十次尝试中,成了他从小就立志做医生的原因。但却发现,这里聚集了许多我在论文中反复引用的学者,财力、从而重建DNA的三维结构。就阻碍了我们理解基因组与疾病产生的机制。”
当他用新技术逐一验证后,
同年,
硕士阶段,
那段时间,主流方法仅能达到数百至数千碱基对的分辨率,


